爱琴海在希腊和土耳其。爱琴海被希腊和土耳其两个国家所分割，爱琴海的岛屿大部分属于西岸的希腊，但特内多斯岛和布罗斯岛属于土耳其，所以两国之间一直在爱琴海域的控制、大陆架资源上存在争议。

爱琴海南通地中海，东北部经过达达尼尔海峡、马尔马拉海、博斯普鲁斯海峡通黑海，南至克里特岛。爱琴海是黑海沿岸国家通往地中海以及大西洋、印度洋的必经水域，在航运和战略上具有重要地位。

爱琴海海域南北长610公里，东西宽300公里，海岸线非常曲折，港湾众多，岛屿星罗棋布，所以爱琴海又有多岛海之称。爱琴海中最大的一个岛名叫克里特岛，面积约8300km²，东西狭长，是爱琴海南部的屏障。