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苹果是典型的呼吸跃变型水果，采后呼吸作用很强，会消耗苹果中的淀粉、糖、果胶和有机酸，使苹果在贮藏过程中变绵、变软，长期贮藏时风味变淡。“低温＋自发气调”是我国苹果贮藏中最常用的方法。所谓的自发气调是指不用气调库，通过塑料薄膜帐或塑料小包装，调节贮藏环境中氧气和二氧化碳的浓度。苹果含水量达到80％~85％，采收后呼吸作用会带走水分,使果皮易失水皱缩，发生失鲜。

不同品种苹果耐贮性相差很大。红富士、小国光、秦冠等晚熟品种较耐贮藏，如红富士苹果推荐贮藏期为5~7个月。元帅系等中熟品种次之，红星系、北斗、乔纳金等中晚熟品种后熟易发绵，多作为中短期贮藏，早熟品种一般只进行周转贮藏。